La nature de tout Service du Renseignement est étroitement liée au secret et les opérations auxquelles participent les Services laissent peu de traces, voire aucune.

Malgré ceci, le CNI s’efforce constamment de ressembler des objets d’une grande valeur symbolique permettant d'illustrer différents épisodes de son histoire. Dans certains cas, les objets s’expliquent par eux-mêmes. Dans d’autres, ils servent à suggérer les opérations ou les épisodes auxquels ils ont participé. Les objets affichés sur ce site sont censés être un petit échantillon permettant à la société espagnole de connaitre le travail du CNI.

La sécurité des communications a toujours été un élément essentiel dans le monde du Renseignement. L'apparition d'internet a constitué une révolution dans ce domaine et à conduit à la création du Centre cryptologique national ; toutefois, de nombreux éléments de cryptage et de décryptage étaient déjà utilisés auparavant.

La section cryptologique du musée du CNI, à accès restreint, est créé en 2015, dans le but de faire connaître l’évolution des systèmes de chiffre utilisés au cours du XXème siècle pour garantir le secret des communications. Des méthodes de chiffrement manuelles utilisées dans la guerre civile espagnole et la Seconde Guerre mondiale y sont exposées, et des méthodes mécaniques, notamment différents modèles d’ENIGMA —développés entre 1927 et 1932—, la machine de chiffrement KRYHA et sa version de poche, ou des machines de la marque HAGELIN CRYPTOS datant des années 1950.

La section opérationnelle du musée du CNI, à accès restreint, est créée en 2015 dans le but de montrer l’évolution de l’Unité opérationnelle. Vous pouvez y voir des appareils tels que des caméscopes, des appareils photographiques, des équipements de communication, des équipements pour la réalisation d’inspections techniques de sécurité et divers outils de travail qui ont été utilisés tout au long de l’histoire pour des travaux opérationnels.

Le musée du CNI dispose d’une section consacrée à la sécurité, à accès restreint, pour montrer l'évolution de la Division de la Sécurité. Elle montre divers outils utilisés par cette division, responsable de la protection des personnes et des installations du Service, tout au long de son existence.